Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg9bQ6EBV9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms