Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarca2Q6DIC0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarca2Q6DIC0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca2Q6DIC0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms