Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms