Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc2Q69ZB8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms