Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Sbno1Q689Z5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Sbno1Q689Z5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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