Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4eQ66X19 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms