Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top2bQ64511 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top2bQ64511 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms