Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf4Q64287 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irf4Q64287 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irf4Q64287 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf4Q64287 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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