Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim24Q64127 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Trim24Q64127 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trim24Q64127 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim24Q64127 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms