Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcncQ62447 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcncQ62447 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcncQ62447 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CcncQ62447 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms