Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TrhQ62361 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrhQ62361 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms