Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnrpcQ62241 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SnrpcQ62241 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms