Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sycp1Q62209 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms