Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd180Q62192 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd180Q62192 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms