Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema3cQ62181 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms