Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx3xQ62167 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx3xQ62167 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx3xQ62167 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx3xQ62167 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx3xQ62167 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms