Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtafrQ62035 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtafrQ62035 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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