Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pabpc2Q62029 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc2Q62029 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms