Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga6Q61739 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga6Q61739 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms