Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrxQ61687 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms