Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ecm1Q61508 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ecm1Q61508 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms