Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfap2bQ61313 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tfap2bQ61313 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms