Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lamb3Q61087 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lamb3Q61087 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms