Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usf1Q61069 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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