Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ncor1Q60974 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ncor1Q60974 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms