Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik1Q60934 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms