Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc6a4Q60857 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc6a4Q60857 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms