Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stxbp3Q60770 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms