Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Csnk2a1Q60737 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a1Q60737 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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