Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms