Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SkiQ60698 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms