Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms