Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brip1Q5SXJ3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms