Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms