Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PkdccQ5RJI4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms