Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms