Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ecm2Q5FW85 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms