Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Eri2Q5BKS4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eri2Q5BKS4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms