Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spag9Q58A65 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms