Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Urb1Q571H0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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