Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3lQ4KL14 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms