Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt35Q497I4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt35Q497I4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms