Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Snx25Q3ZT31 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Snx25Q3ZT31 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms