Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc110Q3V125 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms