Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp48Q3V0C5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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