Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim80Q3V061 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim80Q3V061 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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