Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms