Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTC0

B020004J07Rik, RIKEN cDNA B020004J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004J07RikQ3UTC0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B020004J07RikQ3UTC0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms