Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
B230104I21RikQ3USW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B230104I21RikQ3USW4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms