Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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